一，对epub格式的电子书的文字是可以检索的，比如用filelocatePro 就可以。但阅读epub时，有时需做些文字注释，这些文字注释也想被检索，一直没找到可以支持检索的工具。比如，用sumatraPDF阅读epub，可以添加文字注释或加荧光笔下划线等图形注释。但在SumatraPDF阅读软件里对epub做的文字类型的注释不能被存到epub里，也不能离开SumatraPDF被检索。
二，现在的解决方法是对一些需要做比较多注释的epub，先转为pdf，这就可以解决以上的保存文字注释和支持检索的需要了。但epub转为pdf，多数情况下字体和版面会改变，有些epub里面的支持跳转的脚注超链接就失效了。
求教一下，有没有更好的办法呢？多谢。
使用marginnote4阅读
BookxNote Pro
这个软件是mn3或mn4的pc上的替代品，但它有个大缺点，不与其他pdf软件兼容。就是说，其他pdf软件做的注释，在bookxnote里面不能修改（包括复制，或修改比如文字注释或移动文本框或修改西下划线等），而它的注释，在其他pdf软件里面可以修改。这还是不支持兼容性。
#2提及的mn3和mn4我有，它最大的缺点也是不支持兼容性。
这类自我封闭的软件的开发者的脑子还留在自耕农的年代里。
兼容的问题很复杂，兼容 Adobe 的标准，意味着落入平庸软件那一档，不兼容使用自己的实现更容易脱颖而出。
PDF 本身是 Adobe 的是专有(私有)格式，现在虽然格式和标准已经开放，但是如何实现的代码并没有开源，Adobe 是商业软件，需要保护自己的市场份额可以理解，只是这样就导致第三方开源社区各有各的实现，支持的进度也不一样，涉及到复杂的功能时，兼容问题就很多。。。
多谢回复，之前不知道做到与Adobe已经公开的业内兼容还这么难。但是常见的pdf软件，如foxit福昕，pdfxchange，万兴pdfelement，abbyy的阅读器，都是互相兼容的。#2提到的mn3或mn4与#3的bookxnote分别是移动端和pc端类似的pdf和epub阅读软件，都不与主流pdf兼容。而该2个软件自己又不能完全满足pdf上的所有的需求，他们自己可能也没这个模板，只是满足阅读笔记的一部分功能，那就需要与其他pdf联合使用。我觉得从远期看，封闭的模式不会有利于这2个软件自身的市场扩大。
可以考虑都把书转成epub格式或者都是pdf格式， 然后在一个app里看
找那种能导出为文本、md格式的APP
也可以试试微信读书
据说都有AI总结了
是的，现在对epub，都是用calibre转为pdf，这样，阅读和注释都留在pdf里面，方便以后检索。有时需要的话，用PDF-Xchange_Editotr_Plus增加一下页面，扩大页边空白写文字注释。这个虽然麻烦一点点，但目前没有找到更好的办法了 。