兼容 [\x{F900}-\x{FAD9}]
兼容扩展 [\x{2F800}-\x{2FA1D}]
上面的方法是 @jcz777发的，本坛首屈一指的Emeditor专家。看起来似乎是正则，可以配合macro用。
我还没试过，细节也许需要琢磨。你可以另外发个帖请教jcz777细节。这个应该对很多书友有用。
其实整个日本汉字替换表出来，可以一次过替换：
Emeditor实现快速词典校对操作
textpro也有这种替换表。原理很简单，操作不难，不过要有耐心做替换表。
用老马的textforever也可以操作，还是需要替换表。